Dalam melaksanakan tugas persekutuan, kesaksian dan pelayanannya melalui penerjemahan, penerbitan dan penyebaran Alkitab dan bagian-bagiannya, LAI bekerja sama dengan gereja-gereja di Indonesia didorong semangat saling percaya dan saling memberdayakan dalam semua aspek pelayanan lembaga Alkitab. Dalam semangat ini LAI melayani dan mendapatkan pengakuan semua gereja di Indonesia.
Kerjasama tersebut dinyatakan dalam penandatangan kerjasama antara LAI dengan sinode-sinode gereja di tanah air. Dalam posisinya sebagai badan logistik gereja, LAI menghargai peran gereja sebagai agen utama misi Tuhan di dunia. Ke depan LAI terus berusaha membangun hubungan baru dan kemitraan dengan gereja-gereja yang pada masa sebelumnya tidak sepenuhnya terlibat dalam karya pelayanan Lembaga Alkitab.